ปรินซ์ ออยเก้น (Heavy Cruiser Prinz Eugen) เป็นเรือลาดตระเวณหนักลำสุดท้ายที่เข้าประจำการในกองทัพเรือเยอรมัน ได้ร่วมออกรบครั้งแรกพร้อมกับ เรือประจัญบานบิสมาร์ค (Battleship Bismarck) โดยมีส่วนร่วมในการจมกองเรือรบของราชนาวีอังกฤษ คือ เรือลาดตระเวณประจัญบานฮู้ด (Battle Cruiser Hood) และ สร้างความเสียหายให้กับเรือประจัญบาน ปรินซ์ ออฟ เวลล์ส (Battleship Prince of Wales) โดยที่ปรินซ์ ออยเก้นเองกลับไม่ได้รับความเสียหายแต่อย่างใด
2 กรกฎาคม 1941 ถูกโจมตีทางอากาศโดยเครื่องบินทิ้งระเบิดของอังกฤษ จนได้รับความเสียหาย
11 – 13 กุมภาพันธ์ 1942 เดินทางกลับเยอรมันพร้อมกับเรือชาร์นฮอร์ส (Battle Cruiser Scharnhorst), กีเซเนา (Battle Cruiser Gneisenau)และเรือพิฆาตอื่นๆ อีก 6 ลำ ผ่านทางช่องแคบอังกฤษท่ามกลางการเข้าสกัดโดยกองทัพเรือ และกองทัพอากาศอังกฤษอย่างหนัก ซึ่งมีเรือหลายลำของเยอรมันได้รับความเสียหาย แต่ ปรินซ์ ออยเก้นกลับถึงที่หมายได้อย่างปลอดภัย ไม่เสียหายแม้แต่น้อย (ฝรั่งบอกว่า ไม่พบแม้แต่แม้รอยแมวข่วน !!!!)
13 กุมภาพันธ์ 1942 ถูกโจมตีโดยตอร์ปีโด จากเรือดำน้ำของอังกฤษ นามว่า ไทรเดนท์ (Trident) สร้างความเสียหายอย่างมาก โดยเฉพาะที่หางเสือทำให้หางเสือใช้การไม่ได้ แต่กระนั้นยังสามารถหลบหนีเข้าสมทบกับ เรือเทอร์ปิทซ์ (Battleship Tripitz)และ แอดมิราล เชียร์ (Pocket Battleship Scheer) ที่ ทรอนไฮม์ (Trondheim) ได้ในเวลาต่อมา
17 – 18 พฤษภาคม 1942 เข้าซ่อมแซมครั้งใหญ่ และเข้าสู่ทะเลบอลติกในเดือนตุลาคม
9 มกราคม และ 23 มกราคม 1943 ปรินซ์ ออยเก้น และ ชาร์นฮอร์ส พยายามออกปฏิบัติการอีก แต่ทั้งสองครั้งถูกตรวจพบโดยกองทัพอากาศอังกฤษ จึงต้องยกเลิกปฏิบัติการไป
20 สิงหาคม 1944 ถึง สิ้นสุดสงคราม ปรินซ์ ออยเก้นทำการรบในทะเลบอลติก ปะทะกับเครื่องบินทิ้งระเบิดของรัสเซียหลายต่อหลายครั้ง ทำให้ได้รับความเสียหายบ้างแต่ยังคงทำการยิงสนับสนุนตามแนวชายฝั่งสกัดการรุกของรัสเซียต่อ ที่น่าทึ่งก็คือตลอด 26 วัน (10 มีนาคม – 4 เมษายน 1945) ทำการยิงปืนประจำเรือขนาด 20.3 ซม. ไปทั้งสิ้น 4,871 ลูก ขนาด 10.5 ซม. อีก 2,644 ลูก เมื่อหมดกระสุน ปรินซ์ ออยเก้น ก็ละจากทะเลบอลติกไปในวันที่ 10 เมษายน 1945 และออกเดินทางไปถึงโคเปเฮนเก้น (Copenhagen) ในอีก 10 วันต่อมา
7 พฤษภาคม 1945 ปรินซ์ ออยเก้น และเรือลาดตระเวณเบา เนินเบิร์ก (Light Cruiser Nurnberg) ยอมจำนนต่อ ต่อสัมพันธมิตรที่โคเปนเฮเก้น และถูกส่งมอบให้อังกฤษในวันถัดมา
26 พฤษภาคม 1945 ออกเดินทางพร้อมกับเรือเนินเบิร์ก โดยมีเรือลาดตระเวณดิโด และ โดวอนเชียร์ (Cruiser Dido and Dovenshire) ควบคุมการเดินทางไปยังวิลเฮล์มชาเวน (Wilhelmshaven) เพื่อซ่อมบำรุง
5 มกราคม 1946 อเมริกานำปรินซ์ ออยเก้นเข้าประจำการกับกองทัพเรือสหรัฐอเมริกาในนาม USS Prinz Eugen (IX-300)
22 มกราคม 1946 ออกเดินทางไปยังบอสตัน (Boston) และที่ฟิลาเดลเฟีย (Philadelphia) เพื่อถอดปืนออกจากป้อมปืน อันตอน (Anton) พอเดือนมีนาคม ออกเดินทางสู่มหาสมุทรแปซิฟิกผ่านทางคลองปานามา (Panama Canal)
กรกฎาคม 1946 ปรินซ์ ออยเก้นถูกใช้เป็นเป้าหมายทางทะเล สำหรับการทดลองทิ้งระเบิดนิวเคลียร์โดยเครื่องบิน B - 29 ศูนย์กลางการระเบิดอยู่ห่างจากเรือราว 1,194 หลา แรงระเบิดไม่สร้างความเสียหายให้แก่เรือมากนัก จากนั้น 25 กรกฎาคม 1946 ปรินซ์ ออยเก้นถูกใช้เป็นเป้าหมายทางทะเล สำหรับการทดลองแรงระเบิดนิวเคลียร์ที่อยู่ใต้น้ำที่ความลึก 90 ฟุต ศูนย์กลางการระเบิดอยู่ห่างจากเรือราว 1,990 หลา และเป็นอีกครั้งที่แรงระเบิดไม่สร้างความเสียหายให้แก่เรือมากนัก
สิงหาคม 1946 ถูกปลดประจำการ และในเดือนกันยายน ก็ถูกลากจูงไปเก็บที่ Kwajalein Atoll แต่พอถึง 22 ธันวาคม 1946 เรือเกิดรั่ว และเอียงไป 35 องศา ทำให้พลิกคว่ำในเวลาต่อมา ในแถบ Enubuj
นักประวัติศาสตร์หลายคนต่างก็ยกย่องว่าเรือ ปรินซ์ ออย เก้น เป็นเรือที่โชคดีที่สุดของสงครามโลกครั้งที่ 2 เนื่องจากการเข้าร่วมทางทะเลครั้งใหญ่ที่สุดครั้งหนึ่ง คือ การรบระหว่าง เรือบิสมาร์คและปรินซ์ ออยเก้นฝ่ายหนึ่ง กับเรือฮู้ด และปรินซ์ ออฟ เวลล์ และยังผ่านสมรภูมิอีกหลายครั้งได้อย่างปลอดภัย ประกอบกับการปฏิบัติภาระกิจจนถึงที่สุด (เรียกได้ว่าจนนาทีสุดท้ายของสงคราม)แล้วยังรอดพ้นจากแรงระเบิดในการเป็นเป้าสำหรับการทดสองระเบิดนิวเคลียร์อีกถึง 2 ครั้ง